Tanzimat Devri Konya valilerinden olan Ebubekir Sami Paşa, askerî mektepten zabit olarak mezun olduktan sonra Avrupa’ya tahsile gönderildi. Memlekete döndüğünde mirlivalığa, bir süre sonra da ferikliğe yükseldi. Nihayet Ocak 1845’te vezaretle Erzurum Valiliğine tayin edildi.
Hamdi Paşa’nın azlinden sonra Erzurum valisi iken 1845’te Konya’ya atandı. Bu görevi esnasında ciddi bir başarı gösteremediğinden bir süre sonra azledilerek yerine sabık Bosna Müşiri Osman Nuri Paşa getirildi. Sami Paşa’ya ihtiyaçlarını karşılayabileceği miktarda (7.500 kuruş) maaş bağlanarak Bursa’da ikamete mecbur tutuldu. Ancak Bursa’ya gideceği sırada ikamet yeri kendisinin talebiyle İstanbul’a çevrildi. İstanbul’daki kısa ikametinin ardından Temmuz-Kasım 1848 tarihleri arasında Kastamonu Valiliği yaptı. Kasım 1848’de Selanik Valisi Hıfzı Paşa’nın yerine Selanik Valiliğine atandı. 1849 yılının Haziran ayında vefat etti.
Ebubekir Sami Paşa’nın Konya’daki en önemli icraatı, Alâeddin Tepesi ile Hükümet binası arasında, İplikçi Camii’nin karşısı ve şimdiki Merkez Bankası’nın bulunduğu yerde inşa ettirdiği Ebubekir Sami Paşa veya Paşa Dairesi adıyla anılan medresedir. Sami Paşa’nın Nakşibendî tarikatına bağlılığı sebebiyle bu medreseyi bahsi geçen tarikat mensuplarına tahsis etmiş, müderris olarak da Hacı Himmet Efendi’yi görevlendirmiştir. Ayrıca Konya valiliğinden azledildikten sonra Konya’daki süvari ve piyade kışlası ortasında ve karantina ahırı civarında bulunan harap ahırın tamiri hususunda oluşturulan komisyonda da görev almıştır.