Karatay ilçesi sınırları içerisinde yer alan Çukur Mahallesi, doğuda Akçeşme Mahallesi, kuzeyde Piri Esat Caddesi, batıda Yunusoğlu Mahallesi, güneyde Piri Esat Mahallesi ile çevrilidir.
Çevresinde yer alan tarihî mahallelere rağmen Yavuz, Kanuni ve III. Murat dönemi mahalle listelerinde Çukur Mahalle’nin adı geçmemektedir. XIX. yüzyıl ortalarından sonra Konya şeriye sicillerinde adına rastlanmaktadır. Eski resmî kayıtlarda adı geçmeyen mahallenin, Çukur Mescit çevresinde sonradan kurulduğu veya çevre mahallelerin birisinden bölündüğünü akla getirmektedir.
1847-48 yılı temettüat defterinde mahalle beş grupta toplam 31 kişi olarak vergilendirilmiştir. En yüksek vergi 65, en düşük vergi ise 20 kuruştur. Bundan mahallenin ekonomik açıdan gelişmemiş olduğu anlaşılmaktadır.
Küçük bir mahalle olan Çukur Mahallesi, son yıllarda kuzeyinden geçirilen ve genişletilen caddelerle daha da küçülmüştür. Mahallenin 2007 yılında nüfusu 229’dur.
Yeni açılan caddelerle mahalleden ayrılmış gibi gözüken Çukur Cami de Osmanlının son dönemlerine doğru yapılmış, mimari değeri olmayan bir mescittir. Mescidin doğusunda bulunan eski bir fırın yollar genişletilirken yıkılmıştır.